通風柜有如下過濾程序：用泡沫塑料前過濾除塵，用活性炭過濾，吸附掉很多化學物質。但氨和一氧化碳需要其他的特殊過濾裝置才能除掉。前過濾的材料平均能使用6個月，活性炭層平均2年，但具體壽命要由使用情況而定。
通風柜將柜內空氣抽到別處，經適當處理后排散到大氣中。這類通風柜比無管通風能更有效地除去實驗室有害氣體，噪音小，而且維護簡單。缺點是要安裝專用的排風管道，在室內外溫度不同的情況下可能妨礙實驗室維持恒溫，而且對環境衛生不利。
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